BridgeDock 用扩散桥把共折叠模型改造成柔性对接方法。
资讯摘要
论文提出 BridgeDock，将预训练共折叠模型用于柔性分子对接：把 apo 到 holo 的构象转变建模为扩散桥，从初始蛋白-配体状态出发生成，而非从高斯噪声开始，并引入对齐机制使桥状态匹配预训练去噪调度。作者报告在标准柔性对接基准上持续优于强共折叠基线，推理高效，极少去噪步数下仍有效。
要点速读
- 论文将 apo 到 holo 的转变建模为扩散桥，从初始蛋白-配体状态生成，而非高斯噪声。
- 提出对齐机制，把桥状态映射到预训练模型原有的去噪调度，以兼容预训练去噪器。
- 作者报告在标准柔性对接基准上优于强共折叠基线，且推理高效、极少步数下仍有效。
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采集于 2026/11/4 08:00:28（北京时间）。 arXiv 日期为本次公告时间，论文初次投稿日期请查看原文版本记录。