PROBE：探测引导的分子优化框架

论文提出探测引导的分子优化框架PROBE，缓解亲和力与成药性难以兼顾的问题。

资讯摘要

论文针对LLM智能体在基于结构的药物设计中同时优化结合亲和力与成药性困难的问题，提出两项诊断指标，发现现有流程常在不知口袋-配体复合物如何响应局部修改的情况下编辑分子，难以实现联合提升。作者提出PROBE框架，先分解可编辑位点并构建口袋特异位点图，再通过受控探测编辑蒸馏出EditManual，引导多智能体迭代优化。论文报告在CrossDocked2020基准上取得最优性能并缓解上述失败模式。

要点速读

1. 论文提出两项诊断指标，分别衡量单次编辑同时改善两个目标的比例，以及一个目标提升伴随另一目标下降的比例。
2. PROBE将配体分解为可编辑位点，构建口袋特异位点图，标注可能联合增益、目标冲突及需替换的隐患子结构。
3. 作者报告PROBE在CrossDocked2020基准上达到最优性能，并缓解诊断指标揭示的失败模式。

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采集于 2026/10/27 08:00:28（北京时间）。 arXiv 日期为本次公告时间，论文初次投稿日期请查看原文版本记录。