CausalBind 用稀疏交互因果建模提升虚拟筛选泛化。
资讯摘要
论文提出 CausalBind,将蛋白质-分子虚拟筛选视为稀疏跨模态交互问题,认为结合由少量接触界面和局部相互作用决定,而非全局结构对齐。作者用 Heckman 式选择下的 V 结构因果模型形式化该先验,给出可识别性理论结果,并实现三个变体。在 DUD-E 与 LIT-PCBA 基准上,作者报告各变体均优于强检索基线,LIT-PCBA 早期富集提升最大,并泛化到目标级与骨架级分布外划分。
要点速读
- 论文指出结合由小接触界面和少数局部相互作用(如氢键、疏水接触、盐桥)主导,而非蛋白质与分子的全局结构。
- 作者用 Heckman 式选择下的 V 结构因果模型形式化稀疏交互先验,并给出三条可识别性理论结果。
- 作者报告 CausalBind 三个变体在 DUD-E 和 LIT-PCBA 上均优于强检索基线,LIT-PCBA 早期富集增益最大,并泛化到目标级与骨架级分布外划分。
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采集于 2026/11/5 08:00:38(北京时间)。 arXiv 日期为本次公告时间,论文初次投稿日期请查看原文版本记录。