CHIP 2026 共享任务1：全文文献中患者特异性表型概念识别概述

CHIP 2026 共享任务1最佳系统测试集得分0.7389，超基线8.37个百分点。

资讯摘要

论文概述 CHIP 2026 共享任务1，目标是从生物医学全文文献中识别表型概念并关联到具体患者。任务分全文表型概念识别与患者特异性表型关联两个子任务，使用 PatientPheX 数据集的200篇标注全文文章，含506名患者、15193个表型提及和5656条患者-表型关联。共455支队伍注册，Phase A 与 Phase B 分别收到189和103份有效提交，最佳系统最终测试集总分0.7389，比基线高8.37个百分点。

要点速读

1. 任务设两个子任务：全文表型概念识别、患者特异性表型关联。
2. 数据来自 PatientPheX 的200篇标注全文，含506名患者、15193个表型提及、5656条关联。
3. 455支队伍注册，最佳系统最终测试集得分0.7389，超基线8.37个百分点；参赛队多用生物医学语言模型、LLM 与集成策略。

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采集于 2026/10/23 08:00:11（北京时间）。 arXiv 日期为本次公告时间，论文初次投稿日期请查看原文版本记录。